MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 plasmid1

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008320	CA	3	6	20	25	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008320	ATGT	2	8	107	114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008320	GCG	2	6	144	149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008320	CGT	2	6	196	201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008320	A	7	7	219	225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008320	GGGTG	2	10	226	235	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008320	CTGTCA	2	12	263	274	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008320	T	6	6	308	313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008320	CTC	2	6	315	320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008320	AGCGA	2	10	410	419	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008320	GGC	2	6	449	454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008320	GCG	2	6	486	491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008320	TCTT	2	8	661	668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008320	TCTT	2	8	680	687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008320	CTC	2	6	697	702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008320	GGT	2	6	739	744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008320	GGT	2	6	772	777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008320	GGT	2	6	805	810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008320	TGG	2	6	876	881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008320	CAC	2	6	899	904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_008320	ACT	2	6	2890	2895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008320	A	6	6	2921	2926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008320	A	6	6	2952	2957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008320	GT	3	6	3000	3005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008320	AAG	2	6	3035	3040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008320	AAT	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008320	CTT	2	6	3051	3056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008320	TCC	2	6	3058	3063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008320	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008320	A	8	8	3101	3108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008320	AGAC	2	8	3112	3119	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008320	CGC	2	6	3153	3158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008320	A	6	6	3168	3173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008320	CAC	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_008320	ACG	2	6	3286	3291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008320	CTC	2	6	3408	3413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_008320	TCA	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008320	TATT	2	8	3571	3578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008320	TAG	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008320	A	7	7	3634	3640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008320	CAC	2	6	3641	3646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_008320	TAC	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008320	TGT	2	6	3677	3682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008320	ATT	2	6	3720	3725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008320	ACA	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008320	CCAC	2	8	4417	4424	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_008320	GGT	2	6	4432	4437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008320	AAT	2	6	4449	4454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008320	GCTC	2	8	4460	4467	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008320	TTA	2	6	4488	4493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008320	AAT	2	6	4495	4500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008320	TGC	2	6	4595	4600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008320	GCA	2	6	4614	4619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008320	ATA	2	6	4622	4627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008320	CAT	2	6	4755	4760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008320	AGA	2	6	4816	4821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008320	T	6	6	4827	4832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008320	CAT	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008320	TTC	2	6	4918	4923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008320	CAA	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008320	GGT	2	6	5281	5286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008320	ATC	2	6	5321	5326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008320	A	6	6	6339	6344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008320	AGA	2	6	6398	6403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008320	GATT	2	8	6413	6420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.